कोरोनवायरस वायरस: जीनोम एनालिसिस दो वायरस को संयुक्त करता है

के माध्यम से छवि मिशल इको / अनप्लैश

अलेक्जेंड्रे हसनिन का यह लेख यहां से अनुमति के साथ पुनर्प्रकाशित है बातचीत । यह सामग्री यहां साझा की गई है क्योंकि यह विषय स्नोप्स पाठकों को रुचि दे सकता है, हालांकि, यह स्नोप्स तथ्य-चेकर्स या संपादकों के काम का प्रतिनिधित्व नहीं करता है।




कुछ हफ्तों के अंतरिक्ष में, हम सभी ने COVID-19 और इसके कारण बनने वाले वायरस के बारे में बहुत कुछ सीखा है: SARS-CoV-2। लेकिन कई बार अफवाहें भी उड़ी। और जब इस वायरस पर वैज्ञानिक लेखों की संख्या बढ़ रही है, तब भी इसके उद्भव के रूप में कई ग्रे क्षेत्र हैं।



डॉ रसेल एच। कांवेल्ल

यह किस पशु प्रजाति में हुआ? एक चमगादड़, एक पैंगोलिन या एक अन्य जंगली प्रजाति? यह कहां से आता है? चीनी प्रांत हुबेई की गुफा या जंगल से, या कहीं और?

दिसंबर 2019 में, पहले 41 लोगों में से 27 को अस्पताल में भर्ती (66%) हुबेई प्रांत के वुहान शहर के केंद्र में स्थित एक बाजार से गुजरा। लेकिन, के अनुसार वुहान अस्पताल में किया गया अध्ययन बहुत पहले मानव मामले की पहचान इस बाजार में लगातार नहीं हुई। बजाय, SARS-CoV-2 जीनोमिक अनुक्रमों के आधार पर आणविक डेटिंग अनुमान नवंबर में एक उत्पत्ति इंगित करता है। यह इस COVID-19 महामारी और वन्यजीव के बीच लिंक के बारे में सवाल उठाता है।



जीनोमिक डेटा

SARS-CoV-2 जीनोम चीनी शोधकर्ताओं द्वारा तेजी से अनुक्रम किया गया था। यह एक शाही सेना अणु के लिफ़ाफ़े की सतह पर स्थित एक प्रोटीन के लिए कोड वाले एस जीन सहित 15 जीनों वाले लगभग 30,000 ठिकानों का अणु (तुलना के लिए, हमारा जीन डीएनए के दोहरे हेलिक्स के रूप में है, जिसका आकार लगभग 3 बिलियन है। लगभग 30,000 जीन)।

तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण पता चला है कि SARS-CoV-2 किस समूह का है बेटाकोरोनवीरस और यह बहुत करीब है सार्स-cov तीव्र निमोनिया की महामारी के लिए जिम्मेदार है, जो नवंबर 2002 में चीनी प्रांत ग्वांगडोंग में दिखाई दिया और फिर 2003 में 29 देशों में फैल गया। 774 मौतों सहित कुल 8,098 मामले दर्ज किए गए। यह ज्ञात है कि जीनस के चमगादड़ राइनोफस (संभावित रूप से कई गुफा प्रजातियों) थे इस वायरस का भंडार और यह कि एक छोटा सा मांसाहारी, हथेली की सिवनी ( पगुमा लरवता ), एक के रूप में सेवा की हो सकती है मध्यवर्ती मेजबान चमगादड़ और पहले मानव मामलों के बीच।

तब से, कई बेटाकोरोनवीरस मुख्य रूप से चमगादड़ों में, बल्कि मनुष्यों में भी खोजे गए हैं। उदाहरण के लिए, RaTG13, प्रजाति के बल्ले से अलग राइनोफिडा संबंधित चीन के युनान प्रांत में एकत्रित, हाल ही में SARS-CoV-2 के समान ही वर्णित किया गया है 96% के समान जीनोम अनुक्रम । इन परिणामों से संकेत मिलता है कि चमगादड़, और विशेष रूप से जीनस की प्रजातियों में राइनोफस SARS-CoV और SARS-CoV-2 वायरस के भंडार का गठन।



एक, राइनोफिडा संबंधित
एलेक्जेंडर हसनिन,लेखक ने प्रदान किया

लेकिन आप एक जलाशय को कैसे परिभाषित करते हैं? एक जलाशय एक या कई पशु प्रजातियां हैं जो वायरस के प्रति बहुत संवेदनशील नहीं हैं या नहीं हैं, जो स्वाभाविक रूप से एक या कई वायरस की मेजबानी करेगा। रोग के लक्षणों की अनुपस्थिति को उनकी प्रतिरक्षा प्रणाली की प्रभावशीलता से समझाया गया है, जो उन्हें बहुत अधिक वायरल प्रसार के खिलाफ लड़ने की अनुमति देता है।

पुनर्रचना तंत्र

7 फरवरी, 2020 को, हमें पता चला कि पैंगोलिन में SARS-CoV-2 के करीब एक वायरस भी खोजा गया था। 99% के साथ जीनोमिक कॉन्कोर्डेंस की सूचना दी , इसने चमगादड़ की तुलना में अधिक संभावित जलाशय का सुझाव दिया। हालाँकि, ए समीक्षा के तहत हाल के अध्ययन पता चलता है कि कोरोनोवायरस का जीन मलेशियाई पैंगोलिन से अलग है ( मनिस जावानिका ) SARS-Cov-2 से कम है, केवल 90% जीनोमिक कॉनकॉर्डेंस के साथ। यह इंगित करेगा कि पैंगोलिन में पृथक वायरस वर्तमान में उग्र होने वाले COVID-19 महामारी के लिए जिम्मेदार नहीं है।

क्या ओसियो कॉर्टेज़ कॉलेज गए थे?

हालांकि, पैंगोलिन से अलग कोरोनोवायरस एस प्रोटीन के एक विशिष्ट क्षेत्र में 99% पर समान है, जो एसीई (एंजियोटेंसिन कन्वर्जिंग एनजाइम 2) में शामिल 74 अमीनो एसिड से मेल खाता है, रिसेप्टिंग बाइंडिंग डोमेन, जो वायरस को प्रवेश करने की अनुमति देता है। मानव कोशिकाएँ उन्हें संक्रमित करती हैं। इसके विपरीत, वायरस RaTG13 बल्ले से अलग है संबंधित इस विशिष्ट क्षेत्र में अत्यधिक भिन्नता है (केवल 77% समानता)। इसका मतलब यह है कि पैंगोलिन से पृथक कोरोनोवायरस मानव कोशिकाओं में प्रवेश करने में सक्षम है जबकि एक बल्ले से अलग है संबंधित क्या नहीं है।

इसके अलावा, इन जीनोमिक तुलनाओं से पता चलता है कि SARS-Cov-2 वायरस दो अलग-अलग वायरस के बीच एक पुनर्संयोजन का परिणाम है, एक RaTG13 के करीब और दूसरा पैंगोलिन वायरस के करीब। दूसरे शब्दों में, यह दो पहले से मौजूद विषाणुओं के बीच का एक चमीरा है।

पैंगोलिन का एक कोरोनोवायरस COVID-19 का एक स्रोत हो सकता है।
वन्यजीव गठबंधन / फ़्लिकर , सीसी द्वारा

यह पुनर्संयोजन तंत्र था पहले से ही वर्णित है कोरोनाविरस में, विशेष रूप से SARS-CoV की उत्पत्ति की व्याख्या करने के लिए। यह जानना महत्वपूर्ण है कि एक नए वायरस में पुनर्संयोजन परिणाम संभवतः एक नई मेजबान प्रजातियों को संक्रमित करने में सक्षम है। पुनर्संयोजन होने के लिए, दो अलग-अलग विषाणुओं ने एक ही जीव को एक साथ संक्रमित किया होगा।

दो प्रश्न अनुत्तरित रहते हैं: किस जीव में यह पुनर्संयोजन हुआ था? (एक बल्ला, एक पैंगोलिन या अन्य प्रजाति?) और सबसे ऊपर, यह पुनर्संयोजन किन परिस्थितियों में हुआ?


एलेक्जेंडर हसनिन , सोरबोन यूनिवर्सिटी, ISYEB में एसोसिएट प्रोफेसर (HDR) - इंस्टीट्यूट ऑफ सिस्टमैटिक्स, इवोल्यूशन, बायोडायवर्सिटी (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), प्राकृतिक इतिहास का राष्ट्रीय संग्रहालय (MNHN)

इस लेख से पुनर्प्रकाशित है बातचीत एक क्रिएटिव कॉमन्स लाइसेंस के तहत। को पढ़िए मूल लेख

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